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重磅!不花錢的分子對接平臺上線了

今天的題目略顯浮夸,“重磅”這樣浮躁的字眼竟然也被我們用上了。

但分子對接平臺值得這兩個字,因為這個分析找公司至少千把塊,用這個工具,一分錢不要!

為啥這么貴?

因為好看,放文章里顯著增加逼格,進而增加期刊接受率(我猜的,但誰不喜歡圖片好看的文章呢)。
還因為會做的人少,計算生物學(xué)專業(yè)的同學(xué)會,一般人都不會。
但其實,凡是你的文章或課題結(jié)果里涉及到小分子和靶蛋白結(jié)合,多肽和蛋白結(jié)合,蛋白和蛋白結(jié)合的結(jié)果,都可以增加分子對接的數(shù)據(jù),相當(dāng)于增加了原子水平的的結(jié)合證據(jù),如此顯然就可以讓結(jié)論更加Solid啦。
隨便搜一篇,比如在這篇Nature Communications上的文獻里,作者在實驗的基礎(chǔ)上,進行了分子對接,以說明 QPD-OTf 和驅(qū)動蛋白-1的結(jié)合。

再比如我們平常生信分析里經(jīng)常會分析到蛋白相互作用,針對某個靶蛋白篩選出一些小分子呀,都可以加上了。實驗的時候發(fā)現(xiàn)上下游蛋白直接作用.....
分子對接(Molecular docking)就是從原子水平,通過計算機模擬技術(shù),研究分子之間的相互作用過程。
這個工具支持零基礎(chǔ),零代碼,基于靶蛋白的小分子、多肽、蛋白對接分析,高清結(jié)果圖可在論文中直接使用。

比如

再比如

使用方法小白化。

第一步登錄工具,頁面簡潔無比,頂部支持小分子,多肽,蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)的對接分析,分子哪個選哪個。

左邊可見只需三步完成:第一步是從PDB數(shù)據(jù)庫選擇蛋白的三維結(jié)構(gòu)(PDB是目前收錄蛋白三位結(jié)果的數(shù)據(jù)庫,基本上你想研究的蛋白都能找到。),可以直接搜關(guān)鍵詞或者輸入PDB編號。

第二步:系統(tǒng)自動會選擇使用原對接口袋(位置)還是全蛋白對接范圍。

第三步:選擇小分子,是從PubChem數(shù)據(jù)庫(也是一個收錄小分子化合物的權(quán)威數(shù)據(jù)庫,基本都能找到),也可以直接搜關(guān)鍵詞或者輸入CID編號。

第四步:點擊開始對接!

出圖!

左邊按結(jié)合能排序,越低越好(好理解,需要結(jié)合的能量越低,就越說明能結(jié)合)

可以導(dǎo)出對接結(jié)果的原始文件,投稿不用怕了。

直接點擊下載按鈕,設(shè)置超高清分辨率,獲得高清圖片。

文章寫作呢?

不怕,方法學(xué),結(jié)果,圖例寫作示例也都有了啦,中英文對照哦,(當(dāng)然,也可以用AI寫作助手根據(jù)關(guān)鍵詞搜索,匹配海量文獻語料)。

以下是某個專做分子對接收費的老鐵的試用反饋

??吹竭@,我們就放心了,2個月爆肝沒白干

對不起老鐵,這是科研者之家的使命:“降低科研門檻,提高科研效率,創(chuàng)新科研教育模式”。

希望這個工具對大家有用。

本月推文額度有限,順便把另一個小工具講一下哈。

就是最近給臨床的同學(xué)整了一個可以分享臨床指南(Guideline)的小工具,大家自行分享就行,目前有超過500 個指南,大家自由分享,閱讀學(xué)習(xí)。

最近更新:

1. “審稿人/回復(fù)信”寫作工具總量超135萬個段落。

2. Crosscheck自助查重系統(tǒng)上線,采取市場成本價:1.5萬字35元

3. AI寫作助手CNS期刊等語料開始錄入。

4. Scihub永久鏈接上線(首頁底部按鈕)

5. 簡明統(tǒng)計學(xué)工具上線,包含6種場景。

6. 智能選刊助手上線。

7. 課題思路助手上線。

8. 服務(wù)器第七次擴容,提升檢索速度(8月23日0點-1點)

9.AI寫作助手檢索速度進入“毫秒級”時代

10.CNS語料庫上線

11.自建語料庫功能上線

12.CNS語料庫再次增加1000萬

13.自建語料庫,語料支持收藏、導(dǎo)出、打印

14.家族迎來首個新成員:臨床生信之家 www.aclbi.com,它為”生信0代碼”而生。

15.每日文獻速遞上線

16.同義替換功能上線

17.風(fēng)禾云課堂上線

18.文獻單詞我愛記上線

19.Figdraw繪圖平臺上線

20.22年影響因子預(yù)測上線

21.獲國家級高新技術(shù)團隊認(rèn)證

22.AI降重改寫上線

23.中文版Pubmed上線

24.24小時預(yù)審平臺上線(巧了,名字和序號竟然正好一樣了哈)

25.???特刊追蹤系統(tǒng)上線

26.實驗數(shù)據(jù)探索工具上線

27.臨床指南匯上線

28.分子對接平臺上線

http://www.home-for-researchers.com

“科研不停,神器不止!

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