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實(shí)驗(yàn)萬(wàn)事屋作品
我叫林平之，是莫愁師姐的師弟。已經(jīng)混了一年了，大家估計(jì)都在我的失敗中學(xué)到了好多……
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事情是這樣的，組會(huì)上我拿出了我一個(gè)來(lái)月的實(shí)驗(yàn)結(jié)果，真的是很振奮人心的好么？主要結(jié)果是這樣的，我研究的是A基因。然后做了一下A基因的敲減，結(jié)果發(fā)現(xiàn)A基因敲減后，明星分子B表達(dá)也明顯隨之下降了。然后我又做了一下過(guò)表達(dá)，發(fā)現(xiàn)A基因過(guò)表達(dá)之后，明星分子B的表達(dá)也上升了。
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感覺(jué)已經(jīng)可以發(fā)高端大氣上凳次的文章了！做了辣么多，想想就能夠發(fā)五分以上的文章了！感覺(jué)立馬能在實(shí)驗(yàn)室揚(yáng)眉吐氣了有沒(méi)有？當(dāng)我奢華而又不是內(nèi)涵地把結(jié)果在組會(huì)上講出來(lái)的時(shí)候，魯老板居然說(shuō)要我來(lái)解釋解釋這其中的機(jī)制到底是啥？
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呃，這不就是機(jī)制么？A基因通過(guò)B基因調(diào)控了細(xì)胞的信號(hào)通路，感覺(jué)已經(jīng)很完美了啊，為毛還要我講機(jī)制啊……只能問(wèn)師姐了。
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莫愁：小林啊，其實(shí)你組會(huì)上講的內(nèi)容呢，并不能算是完整的機(jī)制。所謂的機(jī)制，是相對(duì)于表型而言的。表型也就是所謂的可觀察到的變化：比如細(xì)胞凋亡，細(xì)胞壞死，細(xì)胞遷移侵襲能力變化等等，這些，都可以算作為表型。但還有一種表型，被稱為基因表達(dá)的表型。基因的表達(dá)，也能作為一種表型，但表達(dá)的變化和受調(diào)控的機(jī)制并不能從基因的表達(dá)中明確地顯示出來(lái)。所以需要有更深入的機(jī)制研究來(lái)對(duì)其進(jìn)行解釋。
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舉個(gè)例子，就像是這個(gè)燈，你把開(kāi)關(guān)（A基因）按到ON（Over Expression），這個(gè)燈亮了(B基因表達(dá)上調(diào))。再按到OFF（Knock Down），燈就滅了（B基因表達(dá)下調(diào)）。你得到的結(jié)果其實(shí)就是，這個(gè)開(kāi)關(guān)（A基因），位于這個(gè)燈（明星分子B基因）的上游。最簡(jiǎn)單的結(jié)果是這樣的：
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簡(jiǎn)單地來(lái)解釋一下的話，就是，有可能A基因作為一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子，它會(huì)直接調(diào)控B基因的表達(dá)。如果是這樣的話，簡(jiǎn)單地設(shè)計(jì)一些ChIP或者Luciferase的實(shí)驗(yàn)，就可以證明了。
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但也不排除，電路圖會(huì)是這樣的（亂畫的，請(qǐng)不要在意這些細(xì)節(jié)）：
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解釋的話，就是A基因可能根本不會(huì)入核，它只是能調(diào)控B基因的轉(zhuǎn)錄因子入核，來(lái)激活B基因的表達(dá)。那就要先通過(guò)免疫熒光或者原位雜交，看看A基因的表達(dá)位置。接著找出可能調(diào)控B基因的轉(zhuǎn)錄因子，來(lái)研究該轉(zhuǎn)錄因子與A基因的關(guān)系才能得到進(jìn)一步機(jī)制的證明了。
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或者更復(fù)雜的上下游關(guān)系（好吧，我承認(rèn)，我懶得畫了，也不知道下面這個(gè)圖是什么鬼）：
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比如：A基因激活了B基因上游轉(zhuǎn)錄因子抑制物的泛素化，從而促進(jìn)了轉(zhuǎn)錄因子入核，從而促進(jìn)了B基因的表達(dá)上調(diào)。這樣的話會(huì)更加復(fù)雜，需要通過(guò)設(shè)計(jì)一系列的蛋白互作的相關(guān)實(shí)驗(yàn)，才能得到相應(yīng)的證明。大概就是下面這種節(jié)奏：
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這么看的話，你還覺(jué)得你已經(jīng)研究了A基因和B基因表達(dá)相關(guān)性的深入機(jī)制了咩?
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小林子：呃……師姐，我去做實(shí)驗(yàn)了……
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…華麗麗的分割線…
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李莫愁博士：很多小盆友們，會(huì)覺(jué)得SCI的文章套路是下面這個(gè)剛子的：
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一直會(huì)有小盆友抱怨：為啥我做了辣么多實(shí)驗(yàn)，還是被拒了呢，為毛Review一直說(shuō)我研究里木有機(jī)制呢？A基因和B基因之間的相關(guān)性，我這機(jī)制不是已經(jīng)都明明白白地寫了辣么多一堆了嘛！？我要發(fā)高分！我要高大上！
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其實(shí)這樣的套路上，所謂的機(jī)制研究，并不僅僅在于初步的，對(duì)于基因表達(dá)相關(guān)性的探索上。其實(shí)并沒(méi)有說(shuō)明實(shí)質(zhì)上的問(wèn)題。如果講基因B（掛鉤的明星分子）與功能表型進(jìn)行結(jié)合，并且與基因A（所研究的分子）的相關(guān)互作或者影響解釋出來(lái)，才是真正的初步機(jī)制。就像是開(kāi)燈關(guān)燈，你可以說(shuō)某個(gè)基因是某明星分子的上游，或者通過(guò)某個(gè)明星的信號(hào)通路起到了作用。但實(shí)際上可能其中的相關(guān)性會(huì)更復(fù)雜，更深刻。
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單單從開(kāi)關(guān)和燈泡明滅的關(guān)聯(lián)性上，我們是無(wú)法去猜測(cè)其中的實(shí)質(zhì)的，還是需要更深入地設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)，去研究機(jī)制才行。好了，今天就策到這里了。要了解明星分子的話，就回復(fù)“228”，要理解信號(hào)通路的話，就回復(fù)“165”“203”“261”“332”看看吧。要了解SCI的簡(jiǎn)單思路的話，就回復(fù)“170”“191”“198”“274”“134”“149”看看吧……
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