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一文讀懂:融合基因到底是什么鬼

融合基因?yàn)楹挝铮?/b>

    人類基因組上大約有2.5萬個(gè)不同的基因,各自執(zhí)行不同的功能。在腫瘤發(fā)生時(shí),經(jīng)常會發(fā)生基因組水平的斷裂和重新拼接。當(dāng)兩個(gè)基因分別斷成兩半,并且發(fā)生了錯(cuò)誤拼接時(shí),就有可能形成新的基因片段,這就叫做融合基因。大多數(shù)情況下,融合基因可以導(dǎo)致異常序列或功能的蛋白質(zhì)的產(chǎn)生,或者某些基因表達(dá)的失調(diào),從而導(dǎo)致或促進(jìn)腫瘤的發(fā)生。

    上圖顯示了BCR-ABL融合基因的形成示意圖(圖片來源:www.bloodjournal.org/)。在本示例中,第22號染色基因體(橙色)發(fā)生了斷裂,并且斷裂點(diǎn)發(fā)生于BCR基因內(nèi)部,導(dǎo)致BCR基因斷成了兩半;第9號染色體(藍(lán)色)也發(fā)生了斷裂,斷裂點(diǎn)發(fā)生于ABL基因內(nèi)部,導(dǎo)致BCR基因斷成了兩半。然后在基因組重新拼接的過程中,就發(fā)生了關(guān)鍵的異常:BCR基因的前一半和ABL基因的后一半拼接成了一個(gè)新的正常情況下不應(yīng)該有的BCR-ABL基因,這一類的基因就被稱為融合基因。由于BCR-ABL基因的功能發(fā)生了異常,就成為了慢性粒細(xì)胞白血病和部分急性白血病主要的致病原因。

血液病融合基因家族有哪些成員?

    血液病融合基因是其分子生物學(xué)特異性標(biāo)志,目前已明確的較為常見的融合基因有數(shù)十種,常見的有AML1-ETO;BCR-ABL(亞型:ela2、b2a2、b3a2);CBFb-MYH11(亞型:A-J型);E2A-PBX1(亞型:1、1a);MLL-AF4(亞型:MLLex8-11  AF4ex4-7);PML-RARα(亞型:S、L 、V 型);SIL-TAL1(亞型:Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型);TEL-AML1 (亞型:ex5-ex2、ex5-ex3)等等。

    這些常見的融合基因,有時(shí)還會是因非常見的斷裂位點(diǎn)導(dǎo)致的變異型基因序列,經(jīng)常是導(dǎo)致檢測假陰性的原因。還有一些融合基因的伙伴不固定,如MLL基因的伙伴基因已經(jīng)報(bào)道有數(shù)百種。還有的融合基因本身很少見,全世界僅報(bào)道了幾例甚至一例。這些都為有效檢測帶來了困難。

哪些人群需要檢測融合基因?

    疑似白血病的人群;確診為急性髓系白血病、急性淋巴細(xì)胞白血病、慢性粒細(xì)胞性白血病、慢性粒細(xì)胞單核細(xì)胞性白血病、骨髓增生異常綜合征且初診檢測到相關(guān)融合基因,經(jīng)治療后定期復(fù)查或做微小殘留病灶監(jiān)控的人群;有血液腫瘤家族史的高危人群;接觸化學(xué)品或放射源的高危人群。

融合基因檢測的意義何在?

    融合基因檢測對臨床診療及判斷預(yù)后都具有十分重要的意義。有的融合基因提示預(yù)后良好,存在這類基因的患者可以通過化療獲得完全緩解,不需要做造血干細(xì)胞移植,有的融合基因提示預(yù)后不良,存在這類基因的患者提倡早期造血干細(xì)胞治療。融合基因檢測可指導(dǎo)臨床醫(yī)生制定科學(xué)的治療方案,避免發(fā)生治療不足或過度。另外,融合基因檢測對臨床選擇靶向藥物也有重要的指導(dǎo)作用。

我院融合基因檢測開展情況

    陸道培醫(yī)院分子醫(yī)學(xué)室和細(xì)胞遺傳和分子細(xì)胞室為臨床提供了一套系統(tǒng)的融合基因解決方案,可以有效解決常見型和少見型融合基因臨床檢測的問題。

    其中白血病融合基因篩查項(xiàng)目中包括了36種血液腫瘤中最常見的融合基因。對于初診/疑診白血病的患者做這一套檢查,可以快速確定是否有融合基因以及哪一種融合基因陽性。達(dá)到快速診斷和確定疾病類型的目的。并且收費(fèi)只是檢測一種融合基因的3倍。

    融合基因定量項(xiàng)目則實(shí)現(xiàn)了精確的微小殘留病檢測,可以精確定量計(jì)算患者血液或骨髓中白血病細(xì)胞的比例,檢測靈敏度可以達(dá)到數(shù)十萬分之一。這樣就可以對治療效果進(jìn)行更好的評價(jià),更加準(zhǔn)確地判斷患者是否需要繼續(xù)治療或是否需要更換治療方案。

    而且我院融合基因定量項(xiàng)目經(jīng)過技術(shù)和操作流程的改進(jìn),不僅檢測靈敏度更高,而且報(bào)告時(shí)間更快。對于上午10點(diǎn)前送到實(shí)驗(yàn)室的標(biāo)本,當(dāng)天就能出具報(bào)告,減少了臨床等待報(bào)告的時(shí)間,避免病情的延誤。

    尤其具有我院特色的少見型BCR-ABL1融合基因篩查項(xiàng)目,則提供了一套對于少見亞型BCR-ABL1融合基因的檢測方案。目前我院已經(jīng)鑒定出40多種少見型的BCR-ABL1融合基因,這些患者用常規(guī)方法經(jīng)常檢測為陰性,從而極易導(dǎo)致錯(cuò)誤診斷。

    針對伙伴不固定的融合基因,如MLL與其他基因形成的融合基因,我院則提供了FISH探針檢測及FusionFishing等獨(dú)特技術(shù)的解決方案,可以有效地檢測出絕大部分MLL等基因的斷裂和異常拼接,并鑒定其伙伴基因。

    “精確的檢測輔助精準(zhǔn)的醫(yī)療”。陸道培醫(yī)院有國內(nèi)最系統(tǒng)化和最高服務(wù)質(zhì)量的血液病專業(yè)實(shí)驗(yàn)室,秉承“立足本院,服務(wù)全國,因?yàn)閷Wⅲ宰吭健钡墓ぷ骼砟?,圍繞“一切為了患者”這個(gè)中心開展檢驗(yàn)工作,為精準(zhǔn)的治療提供精確的數(shù)據(jù)支持。 

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