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以下是整理的長鏈非編碼RNA(lncRNA, lincRNA)數(shù)據(jù)庫資源列表。
國內(nèi)外長非編碼RNA的研究剛剛興起，希望這資源對國內(nèi)的非編碼RNA的研究者有所幫助。
（1）lncRNABase:提供miRNA調(diào)控長非編碼RNA(lncRNA)、假基因(pseudogene)和環(huán)狀RNA(circRNA)的互作信息和ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡。構建了最全面的包含了14癌癥類型（>6000個樣本）Pan-Cancer（泛癌）表達圖譜和互作網(wǎng)絡。這些調(diào)控互作網(wǎng)絡信息是基于高通量的CLIP-Seq實驗數(shù)據(jù)。網(wǎng)站：http://starbase.sysu.edu.cn/mirLncRNA.php 更新：2013年11月
（2）LNCipedia:對人類的長鏈非編碼RNA的序列和結構全面的注釋。網(wǎng)站：http://www.lncipedia.org 更新：2012年7月
（3） ChIPBase:提供長鏈非編碼RNA的表達圖譜和轉錄調(diào)控的全面鑒定和注釋。整合了高通量的RNA-seq鑒定的lncRNA及其表達圖譜和ChIP-Seq實驗技術鑒定的轉錄因子結合位點。網(wǎng)站：http://deepbase.sysu.edu.cn/chipbase/ 更新：2012年11月
（4）lncRNAdb:提供有生物學功能的長鏈非編碼RNA的全面注釋。這是長鏈非編碼RNA研究領域的大牛Johnmattick實驗室構建的網(wǎng)站。網(wǎng)站：http://www.lncrnadb.org/ 更新：2011年7月

（5）LncRNADisease: 提供了文獻報道的疾病相關的長鏈非編碼RNA的注釋。 網(wǎng)站：http://cmbi.bjmu.edu.cn/lncrnadisease 更新：2012年7月

（6）NONCODE：提供對長鏈非編碼RNA的全面注釋，包括表達和該團隊開發(fā)的ncFANs計算機軟件預測的lncRNA功能。這是非編碼RNA研究的知名數(shù)據(jù)庫，已經(jīng)更新到第三版。網(wǎng)站：http://www.noncode.org更新：2012年1月

（7）NRED： 提供人和小鼠的長鏈非編碼RNA在芯片數(shù)據(jù)的表達信息。這也是Johnmattick實驗室構建的網(wǎng)站。網(wǎng)站：http://jsm-research.imb.uq.edu.au/nred/ 更新：2009年

 

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