原始社會時(shí)期，我們的祖先就在生活實(shí)踐中逐漸發(fā)現(xiàn)了藥物。最初只是用單味藥治病，經(jīng)過長期的經(jīng)驗(yàn)積累，認(rèn)識到對于多數(shù)病證而言，幾味藥配合應(yīng)用的療效優(yōu)于單味藥，于是便逐漸形成了方劑。晉·皇甫謐在《針灸甲乙經(jīng)·序》中云：“伊尹以亞圣之才，撰用神農(nóng)本草以為湯液?！焙笫蓝嘁源藶榉絼┲济?。
在現(xiàn)存醫(yī)書中，最早記載方劑的是1973年長沙馬王堆漢墓中出土的《五十二病方》。本書原無書名，因其將所載之283首方劑（原數(shù)應(yīng)在300首左右）分列于五十二類疾病之下，且原書目錄之末尚有“凡五十二（?。钡淖謽樱蜀R王堆帛書小組命名其為《五十二病方》。該書內(nèi)容比較粗糙，不但沒有方劑名稱，而且有些藥名、病名后世亦未再現(xiàn)。從其內(nèi)容和字義分析，該書成書年代早于《黃帝內(nèi)經(jīng)》和《神農(nóng)本草經(jīng)》。
《黃帝內(nèi)經(jīng)》約成書于春秋戰(zhàn)國時(shí)期，是現(xiàn)存醫(yī)籍中最早的中醫(yī)藥理論經(jīng)典著作。全書雖只載13首方劑，但在劑型上已有湯、丸、散、丹、膏、酒之分，并總結(jié)出有關(guān)辨證、治法與組方原則、組方體例等理論，為方劑學(xué)的發(fā)展奠定了理論基礎(chǔ)。
《漢書·藝文志》曾記載“經(jīng)方十一家”，其中有《五臟六腑痹十二病方》《五臟六腑疝十六病方》《五臟六腑癉十二病方》《風(fēng)寒熱十六病方》《秦始皇帝扁鵲俞跗方》《五臟傷中十一病方》《客疾五臟癲狂病方》《金瘡瘛疭方》《婦人嬰兒方》《湯液經(jīng)法》《神農(nóng)黃帝食禁》等。這些方書現(xiàn)雖已亡佚，但在漢代曾廣泛流傳。
東漢·張仲景著《傷寒雜病論》（約成書于公元205年），后經(jīng)晉·王叔和整理編次，宋·林億等校正刊印，分為《傷寒論》與《金匱要略》。全書創(chuàng)造性地融理、法、方、藥于一體，系統(tǒng)論述了外感與內(nèi)傷的病因、病機(jī)、病證、診治、方劑，前者載方113首，后者載方262首，去其重者，共載方314首。其中絕大多數(shù)方劑配伍嚴(yán)謹(jǐn)，用藥精當(dāng)，療效卓著，被后世譽(yù)為“方書之祖”（《傷寒論集注》），其所載方劑被稱為“經(jīng)方”。
東晉·葛洪著《肘后備急方》（約成書于公元3世紀(jì)末），書中所輯之方，多為價(jià)廉、易得、簡便、有效的單方、驗(yàn)方，反映了晉以前的醫(yī)藥成就和民間療法。東晉·陳延之所撰《小品方》，亦是晉代的一部重要方書，全書理、法、方、藥俱備，對臨床確有指導(dǎo)意義，但原書已于北宋末年亡佚，現(xiàn)有后人輯校本刊行。由晉末劉涓子所傳，南齊·龔慶宣整理而成的《劉涓子鬼遺方》（約成書于公元483年），總結(jié)了晉以前外科方面的經(jīng)驗(yàn)和成就，頗切臨床實(shí)際應(yīng)用，是中國現(xiàn)存最早的外科專著，對后世金瘡、癰疽、疥癬、燙火傷等外科方劑的發(fā)展有很大影響。
唐·孫思邈編撰《備急千金要方》（成書于公元652年），孫氏在序中云：“人命至重，有貴千金；一方濟(jì)之，德逾于此。”故以“千金”名之。全書共30卷，凡232門，合方、論5300余首。孫氏尤其注重醫(yī)德，“若有疾厄來求救者，不得問其貴賤貧富，長幼妍媸，怨親善友，華夷愚智，普同一等，皆如至親之想，亦不得瞻前顧后，自慮吉兇……一心赴救?！惫?82年，孫氏鑒于《備急千金要方》有諸多遺漏，“猶恐岱山臨目，必昧秋毫之端，雷霆在耳，或遺玉石之響”，又撰《千金翼方》以輔之。全書共30卷，包括婦人、傷寒、小兒、養(yǎng)性、補(bǔ)益、雜病、瘡癰、針灸等，凡189門，合方、論、法2900余首。唐代另一著名方書《外臺秘要》是王燾取其數(shù)十年搜集且視為“秘密樞要”的醫(yī)方編著而成（撰于公元752年），全書共40卷，論述內(nèi)、外、婦、兒、五官各科病證，收載醫(yī)方6800余首。該書保存了《深師》《集驗(yàn)》《小品方》等眾多方書的部分內(nèi)容，是研究唐以前醫(yī)學(xué)成就的重要文獻(xiàn)。
宋代王懷隱等編著的《太平圣惠方》是中國歷史上由政府組織編寫的第一部方書（成書于公元992年）。全書共100卷，分1670門，載方16834首。本書是宋以前各家驗(yàn)方及醫(yī)論的匯編，既繼承了前代醫(yī)學(xué)成就，又總結(jié)了當(dāng)代醫(yī)學(xué)經(jīng)驗(yàn)，是一部臨床實(shí)用的方書?！妒?jì)總錄》是繼《太平圣惠方》之后，由政府組織編寫的又一方書巨著（成書于公元1117年）。全書共200卷，載方近20000首，系征集當(dāng)時(shí)民間及醫(yī)家所獻(xiàn)醫(yī)方和“內(nèi)府”所藏秘方，經(jīng)整理匯編而成?！短交菝窈蛣┚址健肥撬未俑幘帧蛣┚值某伤幣浔荆ǔ蹩诠?078—1085年），載方297首。至大觀年間（公元1107—1110年），經(jīng)當(dāng)時(shí)名醫(yī)陳承、裴宗元、陳師文等校正，內(nèi)容有所增訂。至淳祐年間（公元1241—1252年），歷經(jīng)160余年的多次重修，增補(bǔ)至788首方劑。這是中國歷史上第一部由政府編制頒行的成藥藥典，其中許多方劑至今仍在臨床中廣泛應(yīng)用。此外，宋代尚有諸多著名方書，如錢乙《小兒藥證直訣》（成書于公元1119年）、王貺《全生指迷方》（成書于公元1125年）、許叔微《普濟(jì)本事方》（約刊于公元1132年）、陳言《三因極一病證方論》（成書于公元1174年）、王璆《是齋百一選方》（刊于公元1196年）、陳自明《婦人大全良方》（成書于公元1237年）、嚴(yán)用和《濟(jì)生方》（成書于公元1253年）等。
金元時(shí)期，成無己著《傷寒明理藥方論》（成書于公元1156年），是歷史上首次依據(jù)君臣佐使理論剖析組方原理的專著，雖然只分析了《傷寒論》中的20首方劑，但開方論之先河，使方劑學(xué)核心理論得到了新的提升。張?jiān)刂夺t(yī)學(xué)啟源》（刊于公元1186年），全書共3卷，善于化裁古方，自制新方，師古而不泥古。劉完素著《黃帝素問宣明論方》（簡稱《宣明論方》，刊于公元1172年）及《素問玄機(jī)原病式》《素問病機(jī)氣宜保命集》（均刊于公元1186年），提出“六氣皆從火化”，倡導(dǎo)辛涼解表和瀉熱養(yǎng)陰為治療熱病的治則，充分體現(xiàn)了偏重寒涼的治療大法，后世稱為“寒涼派”。張從正著《儒門事親》（刊于公元1228年），全書共15卷，詳細(xì)記述汗、吐、下三法的應(yīng)用，主張“治病應(yīng)著重在祛邪，邪去則正安，不可畏攻而養(yǎng)病”。用藥偏攻慎補(bǔ)，自成“攻下派”。李杲著《內(nèi)外傷辨惑論》（刊于公元1247年）、《脾胃論》（刊于公元1249年）等，重點(diǎn)論述了由于飲食勞倦所致的脾胃疾病，強(qiáng)調(diào)“人以胃氣為本”及“內(nèi)傷脾胃，百病由生”，主張補(bǔ)脾胃、升陽氣等，被后世稱為“補(bǔ)土派”。朱震亨著《格致余論》（刊于公元1347年）、《丹溪心法》（刊于公元1381年），主要論述“陽常有余，陰常不足”之說，獨(dú)重滋陰降火，故后人稱為“滋陰派”。
迨至明代，朱棣編纂《普濟(jì)方》（刊于公元1406年），全書共426卷，載方61739首，是中國現(xiàn)存古醫(yī)籍中載方量最多的方書。李時(shí)珍著《本草綱目》（刊于公元1578年），為本草學(xué)之大成，亦附方11096首。此間，闡發(fā)方劑組方原理的專著亦不斷問世。趙以德著《金匱要略方論衍義》（刊于公元1368年），對《金匱要略》方劑進(jìn)行了較為深入的分析。許宏著《金鏡內(nèi)臺方議》（約撰于公元1422年），對《傷寒論》113方均詳為釋義，是繼《傷寒明理藥方論》之后的又一方論專著。吳崑著《醫(yī)方考》（成書于公元1584年），選歷代良方700余首，按病證分為44類，每類集同類方若干首，“考其方藥，考其見證，考其名義，考其事跡，考其變通，考其得失，考其所以然之故”，是較有影響力的方劑學(xué)專著。張介賓著《景岳全書》（刊于公元1624年），其中“古方八陣”收錄歷代方劑1516首，而“新方八陣”則收載張氏自制方劑186首。“八陣”對方劑以功用分類影響頗深。施沛著《祖劑》（成書于公元1640年），收載主方70余首、附方700余首，以仲景方為祖，將后世方劑同類相附，推衍每類方劑之組方源流，對后世方劑按主方分類及學(xué)術(shù)研究影響重大。
清代，溫病學(xué)派崛起。葉天士著《溫?zé)嵴摗罚诠?/span>1746年），分析了溫邪的傳變規(guī)律，創(chuàng)立了衛(wèi)、氣、營、血的辨證體系。楊璿著《傷寒溫疫條辨》（刊于公元1784年），全書共6卷，詳細(xì)辨析傷寒與溫病，分列脈證與治法，載方180首，附方34首。余霖著《疫疹一得》（撰于公元1794年），雖只有2卷，但對疫疹的治療研究頗具獨(dú)到之處。吳鞠通著《溫病條辨》（撰于公元1798年），創(chuàng)立了三焦辨證，全書共6卷，載方198首，外附3方。此間，尚有許多闡發(fā)方劑理論的專著相繼問世。如羅美著《古今名醫(yī)方論》（刊于公元1675年），選輯歷代名方150余首，方論200余則，既詳述其藥性配伍，又對類似方加以鑒別比較。汪昂著《醫(yī)方集解》（刊于公元1682年），選錄臨床常用方劑，“正方三百有奇，附方之?dāng)?shù)過之”，按功用分類為21門，每方均說明組成、主治、方義及附方加減等，頗具實(shí)用價(jià)值。因其內(nèi)容較多，汪氏又著《湯頭歌訣》（刊于公元1694年），以功用分類為綱，將臨證常用之300余首方劑以七言歌訣形式編纂，對后世影響頗深。王子接著《絳雪園古方選注》（刊于公元1732年），全書共3卷，載方345首。上卷以祖方歸類，獨(dú)明仲景113方；中、下二卷分科列方，方后均附以注言。張秉成著《成方便讀》（刊于公元1904年），全書共4卷，匯集古今成方290余首，編成歌訣并加以方義注釋。
歷代方書和方論專著，極大地豐富了方劑學(xué)之內(nèi)涵，使其逐步成為一門具有完善理論體系的學(xué)科。近年來，隨著中醫(yī)藥高等教育的發(fā)展，系統(tǒng)的方劑學(xué)教材和專著相繼出版，不斷豐富和完善著方劑學(xué)之理論體系。同時(shí)，現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)與方法被廣泛應(yīng)用于方劑學(xué)的研究領(lǐng)域，為方劑學(xué)增添了時(shí)代色彩。
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