《金匱要略》在《內(nèi)經(jīng)》、《難經(jīng)》的理論指導(dǎo)下，運(yùn)用臟腑，經(jīng)絡(luò)、氣血、陰陽(yáng)、表里、寒熱、虛實(shí)以及外感、內(nèi)傷等理論闡述了多種雜病的證治，而以臟腑經(jīng)絡(luò)學(xué)說(shuō)為基本的理論依據(jù)。除《臟腑經(jīng)絡(luò)先后病》、《五臟風(fēng)寒積聚病》作為篇名提出外，這一理論依據(jù)，主要體現(xiàn)在下列幾個(gè)方面：
論述整體觀念
人體五臟之間、五臟與六腑之間、臟腑與經(jīng)絡(luò)之間都有密切的聯(lián)系，一臟有病會(huì)影響他臟，在治病時(shí)要注意照顧整體。本書(shū)一開(kāi)頭就舉肝病為倒，說(shuō)明見(jiàn)到肝病要防止傳脾，應(yīng)當(dāng)先調(diào)補(bǔ)脾臟。這種整體觀念貫穿于全書(shū)的始終。人體是統(tǒng)一的，而人與自然的關(guān)系也是不可分割的，自然界的不正常氣候常常是引起疾病的重要原因。但是，只要“五臟元真通暢，人即安和”，就能適應(yīng)氣候變化，抵御外部侵襲。
說(shuō)明發(fā)病情況
內(nèi)傷雜病發(fā)于里，反缺臟腑的病變，而在疾病過(guò)程中由于感受外邪，往往又兼見(jiàn)經(jīng)絡(luò)病變，病情比較復(fù)雜，治療肘必須分別先后，這就是《臟腑經(jīng)絡(luò)先后病》篇名的由來(lái)，疾病的發(fā)展變化雖多，但首先是病邪乘虛南經(jīng)絡(luò)傳入臟腑。病因必須通過(guò)臟腑經(jīng)絡(luò)而發(fā)生作用，一切疾病的根本原因在人體內(nèi)部變化，離開(kāi)了臟腑經(jīng)絡(luò)，病因也就失去存在的意義。
劃分證候類型
本書(shū)按疾病分篇，既重視辨病，又注意辨證，它是在辨病的基礎(chǔ)上辨證，認(rèn)為證候的產(chǎn)生，是臟腑經(jīng)絡(luò)發(fā)生病變的反應(yīng)。故在劃分證候類型時(shí)，以臟腑經(jīng)絡(luò)為中心。例如中風(fēng)病分在絡(luò)在經(jīng)、入腑入臟，在絡(luò)最輕，在經(jīng)較重，入腑入臟，則病勢(shì)深、病情重。五臟風(fēng)寒證分中風(fēng)與中寒兩類，有肺中風(fēng)、肺中寒，肝中風(fēng)、肝中寒等等。這種劃分證型的用意在于闡明五臟受邪后由內(nèi)到外的一系列病理政變。痰飲咳嗽病除分四飲外，又分別提出水在心、水在肺，水在脾、水在肝和水在腎。水氣病在劃分證型上也有類似情形，在風(fēng)水、皮水等等證候外，還有心水、肝水、脾水、肺水、腎水等名稱。
此外，病位不同，病機(jī)相同的，有肺癰與腸癰，肝著與腎著。病位相同，而病機(jī)相異的有肺痿、肺癰、肺脹，胃反，胃實(shí)等等。
闡述病理
《金匱》闡述病理的基本形式是以臟腑經(jīng)絡(luò)為主體，結(jié)合氣血陰陽(yáng)，寒熱虛實(shí)，邊敘脈癥，邊說(shuō)機(jī)理，以揭露人體內(nèi)在矛盾。如肺痿肺癰咳嗽上氣病篇指出虛寒性肺痿的病理是“肺中冷”?！段迮K風(fēng)寒積聚病》篇論三焦病證說(shuō)：“大腸有寒者多騖（鴨）潴，有熱者便腸垢”；論邪哭（無(wú)故悲傷哭泣）的病理是“血?dú)馍佟薄ⅰ靶臍馓摗??！堆w虛勞病》篇闡述虛勞挾瘀的病理是“經(jīng)絡(luò)營(yíng)衛(wèi)氣傷，內(nèi)有干血”等等。
論證脈象
脈象的變化，反映氣血活動(dòng)的變化，而氣血產(chǎn)生于臟腑，流動(dòng)于經(jīng)絡(luò)，因此，臟腑經(jīng)絡(luò)病變必反映于脈。《金匱》常通過(guò)脈象來(lái)闡明臟腑病變。例如論肺痿肺癰時(shí)說(shuō)：“脈數(shù)虛者為肺痿，數(shù)實(shí)者為肺癰?！闭撓实闹邢C說(shuō)：“趺陽(yáng)脈數(shù)，胃中有熱，即消谷引食?！闭擖S疸的病理說(shuō)：“寸口脈浮而緩”，“脾色必黃，瘀熱以行?！闭f(shuō)明由于感受外邪，導(dǎo)致脾濕蘊(yùn)郁化熱，發(fā)為黃疸。
判斷預(yù)后
內(nèi)傷疾病的根源在于內(nèi)臟的變化，其預(yù)后好壞也決定于臟腑本氣的虛實(shí)和病勢(shì)的趨陽(yáng)。所以本書(shū)以“入臟”“入腑”為判斷預(yù)后的重要依據(jù)，有“唇口青、身冷，為入臟即死”，“身和、汗自出，為入腑即愈”之說(shuō)。由于五臟為陰，主內(nèi)，六腑為陽(yáng)，主_外，“六腑氣絕于外”，“五臟氣絕于內(nèi)”，則變證叢生，預(yù)后不良。
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