免疫沉淀和免疫印跡(Western Blotting)
在細(xì)胞生物學(xué)研究中,有時(shí)要對(duì)細(xì)胞膜分子、胞內(nèi)分子或表達(dá)產(chǎn)物進(jìn)行定性或/和定量。但由于靶蛋白表達(dá)水乎不太高,用細(xì)胞裂解液或表達(dá)上清進(jìn)行SDS-PAGE電泳、免疫印跡(Western blot)檢測(cè)很難達(dá)到實(shí)驗(yàn)?zāi)康?。為此可用特異性識(shí)別靶蛋白的抗體進(jìn)行免疫沉淀,純化和富集靶抗原。免疫沉淀所獲得的蛋白可進(jìn)行SDS-PAGE電泳,經(jīng)考馬氏亮藍(lán)染色或銀染后觀察目的蛋白條帶。如果免疫沉淀得到的目的蛋白量低于考馬氏亮藍(lán)染色或銀染的檢測(cè)下限,可采用 Western blot檢測(cè)方法,提高檢測(cè)的靈敏度,達(dá)到實(shí)驗(yàn)?zāi)康摹?/span>
免 疫 沉 淀
(一)原理
免疫沉淀是利用抗原抗體特異性反應(yīng)純化富集目的蛋白的一種方法??贵w與細(xì)胞裂解液或表達(dá)上清中相應(yīng)的蛋白結(jié)合后,再與蛋白 A/G(Protein A/G)或二抗偶聯(lián)的agaose或Sepharose珠子孵育,通過(guò)離心得到珠子-蛋白A/G或二抗-抗體-目的蛋白復(fù)合物,沉淀經(jīng)洗滌后,重懸于電泳上樣緩沖液,煮沸5-10 min,在高溫及還原劑的作用下,抗原與抗體解離,離心收集上清,上清中包括抗體、目的蛋白和少量的雜蛋白。
(二)試劑
1.PBS:8g NaCl、0.2 g KCl、1.44g Na2HPO4、0.24g KH2PO4溶于800 ml雙蒸水中,用HCl調(diào)PH至7.4,在補(bǔ)加水至1L,高壓滅菌后保存于室溫。
2.NaCl:5.8 g NaCl溶于 80 ml雙蒸水中,再補(bǔ)加水至100 ml,高壓滅菌。
3.1 1M Tris(pH 7.5): 12.1g Tris堿,溶于80 ml雙蒸水,用 HCl調(diào) pH至7.5,再補(bǔ)加水至100 ml。
4.蛋白酶抑制劑:Aprotinin和Leupeptin溶于雙蒸水,PMSF溶于異丙醇,濃度均為10 mg/ml。
5.N-40:10%(w/V)。
6.脫氧膽酸鈉:10%(w/v),溶于10 mM HEPES(pH 8.0)。
7.細(xì)胞裂解液:50 mM Tris(pH 7.5)、150 mM NaCl、0.1 mg/ml PMSF、1 ug/ml Aprotinin、1ug/ml Leupeptin、l%NP-40、0.5%脫氧膽酸鈉。
8.稀釋液:50 mM Tris(PH 7.5)、150 mM NaCl、0.1 mg/ml PMSF、1 ug/ml Aprotinin,1 ug/ml Leupeptin、0.1%NP-40。
9.洗滌液 Ⅰ:50 mM Tris(pH 7.5)、150 mM NaCl、0.1%NP-40。
10.洗滌液Ⅱ:10 mM Tris(pH 7.5)。
11.Protein A/G-Agarose。
12.2×SDS-PAGE電泳上樣緩沖液:100 mM Tris(pH 6.8)、200 mM DTT、4%SDS、0.2%溴酚藍(lán)、20%甘油。
(三)操作步驟
1.離心收集細(xì)胞,PBS洗滌2次。細(xì)胞用量根據(jù)目的蛋白表達(dá)的水平而定,一般用 1×107-5×107 細(xì)胞。
2.按 1×107 細(xì)/ml加人細(xì)胞裂解液,于冰浴上超聲破碎,然后再冰浴 30 min。
3.4℃ 12 000 ×g離心 10 mn,取上清。
4.往上清中加人50 ul的蛋白 A/G-agarose,于4℃在搖床上溫和搖1-3 h進(jìn)行預(yù)清除。
5.12 000轉(zhuǎn)離心20 s,取上清。
6.將上清等分成兩份,補(bǔ)加稀釋液至1ml,其中一份加人1-10 ug識(shí)別目的蛋白的抗體,另一份加人等量的對(duì)照抗體,于4℃在搖床上溫和搖2 h,然后加入50 ul的蛋白A/G-Agarose于4℃在搖床上溫和搖過(guò)夜。
7.離心棄上清,用洗滌液Ⅰ洗沉淀4次,洗滌液Ⅱ洗 2次,每次洗滌于4℃在搖床上溫和搖20 min。
8.離心棄上清,用4號(hào)針頭盡可能移去液體。
9.加人20-50 ul的電泳上樣緩沖液,于100℃煮5-10 min,離心收集上清。上清中含有目的蛋白和抗體,可進(jìn)一步用蛋白電泳和Western blot進(jìn)行定性和定量。
(四)注意事項(xiàng)
1.不同種屬來(lái)源及不同亞類(lèi)的抗體與蛋白A和蛋白G的-結(jié)合力不同(表),有的甚至不能結(jié)合,如小鼠的 IgM,這類(lèi)抗體不能用蛋白 A/G-agarose直接免疫沉淀。
2.PMSF對(duì)身體有害,注意防護(hù)。
3.根據(jù)免疫沉淀的結(jié)果,洗滌液Ⅰ的鹽離子濃度可作一定的調(diào)整,如果沉淀的雜蛋白較多可適當(dāng)增加鹽濃度,如果抗體與目的蛋白的結(jié)合力較弱則適當(dāng)減低鹽濃度。
不同種屬和不同亞類(lèi)抗體與Protein A、Protein G的結(jié)合力
| Protein A | Protein G | Protein A/G |
Human IgG | S | S | S |
Human IgG1 | S | S | S |
Human IgG2 | S | S | S |
Human IgG3 | W | S | S |
Human IgG4 | S | S | S |
Human IgM | w | nb | w |
Human IgA | w | nb | w |
Human IgA1 | w | — | S |
Human Ig A2 | w | — | S |
Human IgD | nb | nb | w |
Mouse IgG | S | S | S |
Mouse IgG1 | w | w/s | w/s |
Mouse IgG2a | S | S | S |
Mouse IgG2b | S | S | S |
Mouse IgG3 | S | S | S |
Mouse IgM | nb | nb | nb |
Horse IgG | w | S | S |
Horse IgG(c) | w | nb | w |
Horse IgG(T) | nb | nb | nb |
Rabbit IgG | S | S | S |
Goat IgG | w | S | S |
Rat IgG | w | w/s | w/s |
Sheep IgG | w | S | S |
Cow IgG | w | S | S |
Guinea Pig IgG | S | w | S |
Pig IgG | S | w | S |
Dog IgG | S | w | S |
Cat IgG | S | w | S |
Monkey IgG(Rhesus) | S | S | S |
Chicken IgG | nb | nb | nb |
w:Weak binding,S:Strong binding,w/s:Indifferent,
nb:No binding,—:Information not available
免疫印跡(Western blotting)
(一)原理
Western blot是一種在 PVDF或硝酸纖維素(NC)膜上進(jìn)行的抗原抗體反應(yīng)。蛋白電泳后,將蛋白轉(zhuǎn)移至膜上,再與特異性抗體孵育,洗去游離的抗體,然后和酶標(biāo)記的二抗孵育,再進(jìn)行底物顯色。由于抗原抗體反應(yīng)特異性好,親合力高,Western blot檢測(cè)的靈敏度較高,尤其是采用酶促增強(qiáng)化學(xué)發(fā)光的方法(ECL)后,檢測(cè)的下限可達(dá)到pg水平。ECL是指酶催化底物發(fā)熒光,熒光可使X光片曝光。由于酶標(biāo)記在二抗上,二抗與一抗結(jié)合,而一抗特異性結(jié)合在目的蛋白條帶處,因此顯影、定影后觀察到的條帶即為目的蛋白帶。
(二)試劑和材料
1. PVDF膜或NC膜。
2.電泳緩沖液:25 mM Tris堿、250 mM甘氨酸、0.1%SDS。
3.轉(zhuǎn)移緩沖液:實(shí)驗(yàn)所用的PVDF或NC膜不同,轉(zhuǎn)移緩沖液也可能不同,因此請(qǐng)仔細(xì)參閱PVDF或NC膜說(shuō)明書(shū)。
4.TBS(pH7.5):6.05 g Tris堿(50mM)、8.76g NaCl(150mM)溶于800 ml雙蒸水,用 HCl調(diào) PH至7.5,補(bǔ)加水至1L。
5.TBST:TBS+0.1%(v/v)Tween 20。
6.封閉液:1%試劑盒中的封閉液,或5%脫脂奶粉,溶于TBS中。
7.解離液:100 mM 二巰基乙醇、2%SDS。
8.化學(xué)發(fā)光Western blot試劑盒:生產(chǎn)這類(lèi)試劑盒的公司包括 Roche、Pierce、Amersham 等,試劑盒中一般包括酶標(biāo)記二抗、發(fā)光波A和B。
(三)操作步驟
1. 灌制SDS-PAGE電泳膠,方法參見(jiàn)一般的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)方法。
2. 取免疫沉淀最后所得的上清,上樣,電泳。
3. 用電轉(zhuǎn)移裝置將蛋白轉(zhuǎn)至PVDF或NC膜上。
4. 電轉(zhuǎn)移完畢后,取出膜,用TBS洗滌1次。
5. 將膜放入封閉液 于室溫封閉1 h, 或4℃封閉過(guò)夜。
6. 用封閉液稀釋識(shí)別目的蛋白的抗體至1-10 ug/ml,與含有目的蛋白條帶膜在室溫作用1 h。
7. TBST洗膜4次,每次15 min。
8. 按試劑盒說(shuō)明書(shū)稀釋酶標(biāo)記二抗,與膜于室溫作用30min。
9. TBST洗膜4次,每次15 min。
10. 按試劑盒說(shuō)明書(shū)混合發(fā)光液A和B,與膜作用1 min后進(jìn)行X光片曝光。
11. X光片顯影和定影后觀察結(jié)果。
12. 如果結(jié)果不理想或要用相同的膜檢測(cè)另一種靶蛋白,可將膜與解離液于50℃作用30 min,去除結(jié)合于膜上的抗體, TBST洗2次,封閉后可重新檢測(cè)(即重復(fù) 6-11步)。
(四) 注意事項(xiàng)
1.用于 Western blot和免疫沉淀的抗體最好不同,否則將出現(xiàn)很多非特異性條帶。
2. Western blot中,轉(zhuǎn)移在膜上的蛋白處于變性狀態(tài),其空間結(jié)構(gòu)被改變,因此那些識(shí)別空間表位的抗體不能用于Western blot檢測(cè)。這種情況下,可將表達(dá)目的蛋白的細(xì)胞或細(xì)胞裂解液中的所有蛋白先生物素化,再用抗體進(jìn)行免疫沉淀,得到的生物素化的目的蛋白可用酶標(biāo)記親和素進(jìn)行Western blot檢測(cè)。
3.化學(xué)發(fā)光法檢測(cè)的敏感度很高,實(shí)驗(yàn)中取膠和膜必須帶一次性手套。
4. 曝光、顯影和定影需在暗室中進(jìn)行,X光片用完后一定要收好,避免曝光。
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