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lncRNA在癌癥中的作用可謂不容小覷,包括表觀遺傳調(diào)控、DNA損傷和細(xì)胞周期調(diào)控、對microRNA的調(diào)控、參與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路和介導(dǎo)激素導(dǎo)致的癌癥。它們可以作為癌基因和抑癌基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控分子。比如過表達(dá)的HOTAIR lncRNA與惡性乳腺癌、結(jié)腸癌、肝癌和胃腸道間質(zhì)瘤有關(guān)。而lncRNA TARID可以預(yù)防癌癥形成,通過甲基化抑癌基因的表達(dá)。
長非編碼RNA(lncRNAs)在癌癥中的生物學(xué)功能,包括表觀遺傳調(diào)控、DNA損傷和細(xì)胞周期控制,對microRNA的調(diào)控,參與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,介導(dǎo)激素導(dǎo)致的癌癥等。
表觀遺傳是指遺傳表型和基因表達(dá)發(fā)生了可遺傳的改變,而不涉及DNA 序列的變化,主要包括DNA 甲基化、組蛋白修飾和染色質(zhì)重塑等修飾形式。近年來研究表明,lncRNAs 通過表觀遺傳調(diào)控介導(dǎo)癌癥發(fā)生中起到至關(guān)重要的作用。
lncRNAs 能夠通過表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控以及轉(zhuǎn)錄后調(diào)控等多個層面調(diào)節(jié)基因的表達(dá),從而參與癌癥中細(xì)胞增殖、分化和凋亡等多種生物學(xué)過程。
在癌癥發(fā)展過程中,lncRNAs 參與了多種表觀遺傳復(fù)合物的調(diào)節(jié)過程,從而抑制或激活基因的表達(dá)。例如,lncRNAs可以與多梳蛋白復(fù)合體結(jié)合來調(diào)控癌癥發(fā)生。PRC1和2是已知的致癌基因,能夠?qū)е略S多惡性腫瘤的發(fā)生。FAL1 lncRNA 與PRC1的亞基BMI1結(jié)合。在卵巢癌,FAL1被證明可以加快癌癥的進(jìn)展和縮短病人的生存時間。FAL1與BMI1結(jié)合可阻止BMI1降解以穩(wěn)定PRC1復(fù)合物,這可使PRC1占據(jù)和抑制p21等目標(biāo)基因的啟動子,導(dǎo)致細(xì)胞周期失調(diào)和增加腫瘤發(fā)生的機(jī)會。
除了PRC復(fù)合物,lncRNAs還與SWI/SNF染色質(zhì)重塑復(fù)合物有關(guān),SWI/SNF是一類重要的依賴ATP的染色質(zhì)重塑復(fù)合物,能夠改變核小體的高級折疊結(jié)構(gòu),干擾組蛋白與DNA結(jié)合,暴露啟動子序列的結(jié)合位點,使轉(zhuǎn)錄因子能與特異性啟動子序列結(jié)合,從而激活基因轉(zhuǎn)錄。Lnc TCF7在肝癌細(xì)胞(HCC)高表達(dá),在肝癌干細(xì)胞的自我更新能力的維護(hù)中起重要作用。Lnc TCF7可以激活Wnt信號通路,通過結(jié)合和募集SWI/SNF復(fù)合物來與TCF7基因的啟動子結(jié)合激活基因的表達(dá),這導(dǎo)致了肝癌腫瘤的發(fā)生。
除此以外,lncRNAs還可以參與由DNA 甲基化、乙?;冉閷?dǎo)的基因轉(zhuǎn)錄過程來調(diào)控腫瘤發(fā)生過程。
lncRNAs 廣泛參與DNA 損傷修復(fù)、細(xì)胞周期調(diào)控等生理或病理過程調(diào)控腫瘤的發(fā)生發(fā)展。
對DNA損傷進(jìn)行修復(fù)和細(xì)胞周期檢查點的適當(dāng)調(diào)節(jié)對于維持細(xì)胞的完整性很重要。p53 基因是研究最廣泛的抑癌基因之一, 也是細(xì)胞內(nèi)的一個強(qiáng)大的轉(zhuǎn)錄因子, 在正常狀態(tài)下呈低水平表達(dá)。在各種應(yīng)激包括DNA 損傷時, p53 可以被不同的信號通路激活, 通過增強(qiáng)其下游多種基因的轉(zhuǎn)錄而引起細(xì)胞周期阻滯、凋亡或衰老, 保持細(xì)胞基因組的完整性并清除損傷細(xì)胞。
在癌癥中,lncRNAs作為調(diào)控分子調(diào)控P53基因和細(xì)胞周期。例如,lincRNA-p21召集核糖核蛋白hnRNP-k來促進(jìn)P21的轉(zhuǎn)錄,P21是一種調(diào)控p53信號通路的關(guān)鍵分子。lincRNA-p21的缺失使得G1/S檢查點失控導(dǎo)致細(xì)胞的增殖增加。
還有,lncRNA gadd7可抑制細(xì)胞周期G1/S 期轉(zhuǎn)換,在DNA受到紫外線、鉑順化合物和生長抑制等損傷時會誘導(dǎo)lncRNA gadd7的表達(dá)。
總的來說,這些機(jī)制表明lncRNAs在DNA損傷修復(fù)、細(xì)胞周期過程、細(xì)胞凋亡調(diào)控中是至關(guān)重要的把關(guān)分子,在這些過程中,lncRNA的失調(diào)會讓癌細(xì)胞獲得永生性。
microRNA與很多疾病的發(fā)生發(fā)展有關(guān),包括癌癥。miRNA可與靶RNA互補(bǔ)配對,導(dǎo)致基因的表達(dá)受制和蛋白合成受阻。
可謂“本是同根生,相焦何太急?”,同為非編碼RNA,但lncRNAs可以將microRNA“玩弄于股掌之中”,通過改變microRNA的功能來介導(dǎo)癌癥的發(fā)生。LncRNAs可與microRNA直接或間接作用,導(dǎo)致其失去調(diào)節(jié)功能。
例如,H19lncRNA,是一個被研究了數(shù)十年的重要的癌癥發(fā)生遺傳因素。H19 lncRNA編碼和產(chǎn)生mir-675促進(jìn)胃癌、結(jié)直腸癌、神經(jīng)膠質(zhì)瘤的發(fā)生。
PCAT-1 lncRNA在前列腺癌組織中高表達(dá),PCAT-1 lncRNA可通過干擾miR-34調(diào)控MYC的表達(dá)。研究表明,PCAT-1lncRNA結(jié)合MYC 3‘非翻譯區(qū),防止miR-34a作用于目標(biāo)序列。
研究表明,LncRNAs是作為一種競爭性內(nèi)源性 RNA 與miRNA相互作用,參與靶基因的表達(dá)調(diào)控。
已有確鑿的證據(jù)證明信號通路的異常激活與癌癥的發(fā)生發(fā)展有關(guān)。lncRNAs在這些信號通路中的作用已經(jīng)成為癌癥發(fā)生機(jī)制的重要組成部分。所以對lncRNAs的研究也有望找到有潛力的治療癌癥的藥物。
已有研究證實轉(zhuǎn)化生長因子β(TGF-β),Hedgehog信號通路、Wnt信號通路在腫瘤發(fā)展中的作用。例如,TGF-β可通過lncRNA-ATB促進(jìn)肝癌癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移。異常的Hedgehog信號導(dǎo)致H19 lncRNA 表達(dá)升高,促進(jìn)小鼠骨肉瘤發(fā)生。
一些癌癥是由激素調(diào)節(jié)紊亂所致。尤其是,雌激素和雄激素能刺激乳腺癌和前列腺癌的發(fā)生。鑒于這些激素受體通路在推動癌癥惡化的關(guān)鍵作用,lncRNAs也參與其中也就不足為奇了。
雄激素受體(AR)在前列腺癌進(jìn)展中起著重要的作用。事實上,治療前列腺癌的方法主要包括雄激素剝奪療法(ADT)。 雄激素刺激后,AR結(jié)合兩個抑制雄性激素的lncRNAs PCAT29和DRAIC ,抑制促癌基因的轉(zhuǎn)錄。低PCAT29和DRAIC表達(dá)與前列腺癌患者的不良預(yù)后狀況相關(guān)。
lncRNAs可以作為診斷和預(yù)后的生物學(xué)標(biāo)記物,可以在組織、血清和尿液中檢測出來。
研究lncRNAs的方法包括lncRNA與其他分子的相互作用分析、轉(zhuǎn)錄可視化、定位分析、結(jié)構(gòu)分析,發(fā)現(xiàn)開放閱讀框架(sORFs)產(chǎn)生的小肽短和鑒定lncRNA的亞型。常用分析方法:RNA-染色質(zhì)共沉淀、FISH、icSHAPE、RAP技術(shù)、RBP技術(shù)等。
lncRNAs可以調(diào)節(jié)癌癥發(fā)生的方方面面。雖然目前我們對于lncRNAs的認(rèn)識有明顯的增長,但這只是冰山一角,lncRNAs在癌癥中行使的復(fù)雜生物學(xué)功能,其詳細(xì)的調(diào)控機(jī)制仍有待深入研究。
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