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MEDLINE是一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)，是美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館（The National Library of Medicine，NLM）生產(chǎn)的國(guó)際性綜合生物醫(yī)學(xué)信息書目數(shù)據(jù)庫(kù)，是當(dāng)前國(guó)際上最權(quán)威的生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)。內(nèi)容包括美國(guó)《醫(yī)學(xué)索引》（Index Medicus，IM）的全部?jī)?nèi)容和《牙科文獻(xiàn)索引》（Index to Dental Literature）、《國(guó)際護(hù)理索引》（International Nursing Index）的部分內(nèi)容，涉及基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、環(huán)境醫(yī)學(xué)、營(yíng)養(yǎng)衛(wèi)生、職業(yè)病學(xué)、衛(wèi)生管理、醫(yī)療保健、微生物、藥學(xué)、社會(huì)醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域。MEDLINE收錄1966年以來(lái)世界70多個(gè)國(guó)家和地區(qū)出版的3400余種生物醫(yī)學(xué)期刊的文獻(xiàn)，近960萬(wàn)條記錄。目前每年遞增30-35萬(wàn)條記錄，以題錄和文摘形式進(jìn)行報(bào)道，其中75%是英文文獻(xiàn)，70%-80%文獻(xiàn)有英文文摘。

PubMed是一個(gè)免費(fèi)的搜索引擎，是NLM所屬的國(guó)家生物技術(shù)信息中心（NCBI）于2000年4月開發(fā)的，基于WEB的生物醫(yī)學(xué)信息檢索系統(tǒng)（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/），提供生物醫(yī)學(xué)方面的論文搜尋以及摘要。它的數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)源有：MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied by publisher等，數(shù)據(jù)類型：期刊論文、綜述以及與其他數(shù)據(jù)庫(kù)鏈接。其核心主題為醫(yī)學(xué)，但亦包括其他與醫(yī)學(xué)相關(guān)的領(lǐng)域，像是護(hù)理學(xué)或者其他健康學(xué)科。它同時(shí)也提供對(duì)于相關(guān)生物醫(yī)學(xué)資訊上相當(dāng)全面的支援，像是生化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)。PubMed的資訊并不包括期刊論文的全文，但可能提供指向全文提供者（付費(fèi)或免費(fèi)）的連結(jié)。

有人認(rèn)為，PubMed和MEDLINE聯(lián)機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù)只不過(guò)是同一內(nèi)容的兩種不同版本。但是，當(dāng)我們用這兩個(gè)版本對(duì)同一個(gè)課題進(jìn)行檢索時(shí)，就會(huì)發(fā)現(xiàn)其結(jié)果明顯不同。主要表現(xiàn)在以下幾點(diǎn)：

（1）文獻(xiàn)的收錄范圍    MEDLINE是PubMed系統(tǒng)的最大組成部分。PubMed收錄范圍包括：①MEDLINE聯(lián)機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù)；②PREMEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)。PREMEDLINE收錄那些進(jìn)入MEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)之前正在進(jìn)行標(biāo)引處理中的文獻(xiàn)記錄。這些文獻(xiàn)在MEDLINE聯(lián)機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索不到；③由出版商直接提供給PubMed的文獻(xiàn)。出版商提供給PubMed的文獻(xiàn)，一些在后來(lái)進(jìn)入了MEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)，而另外一些不被MEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)收錄的文獻(xiàn)則作為由出版商提供的記錄被永久保留在PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)；④MEDLINE選擇性收錄期刊中的非生物醫(yī)學(xué)文章和MEDLINE收錄時(shí)間范圍以外的文章；⑤來(lái)自于OLDMEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)中的一些沒有更新主題詞的文獻(xiàn)記錄。與MEDLINE聯(lián)機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù)相比，PubMed收錄的文獻(xiàn)量大、類型全、專業(yè)范圍廣。

（2）數(shù)據(jù)庫(kù)的更新速度     MEDLINE聯(lián)機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù)為周更新，而PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)每天接受來(lái)自于PREMEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)中的新紀(jì)錄，出版商則直接將期刊中的文章以電子版的形式提供給PubMed上網(wǎng)運(yùn)行。所以，PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)更新速度快、文章新。

（3）檢索機(jī)制    MEDLINE聯(lián)機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù)是在Index Medicus的基礎(chǔ)上建立起來(lái)的，主題詞檢索時(shí)Index Medicu的主要檢索途徑，也是MEDLINE聯(lián)機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù)的主要檢索途徑。所以，掌握醫(yī)學(xué)主題詞表《MeSH》是用MEDLINE檢索文獻(xiàn)的首要條件。而PubMed具有詞匯自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配功能，檢索人員即使對(duì)MeSH不了解也能檢索。

當(dāng)在MEDLINE聯(lián)機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù)和PubMed兩個(gè)檢索系統(tǒng)分別用disease resistance檢索2000—2008年的文獻(xiàn)時(shí)發(fā)現(xiàn)，MEDLINE聯(lián)機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù)只檢索到1 704條文獻(xiàn)，而PubMed則檢索到了57 063條文獻(xiàn)。因?yàn)?/span>MEDLINE聯(lián)機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù)只能將文章篇名、文摘中含有與檢索詞完全一樣的記錄檢索出來(lái)，而PubMed具有詞義識(shí)別功能，能根據(jù)檢索詞的詞義自動(dòng)轉(zhuǎn)換為相應(yīng)的主題詞，并對(duì)主題詞自動(dòng)擴(kuò)展檢索。因此，PubMed檢索機(jī)制靈活，具有較高的查準(zhǔn)率和查全率。

（4）鏈接功能    PubMed具有與免費(fèi)全文鏈接、相關(guān)文獻(xiàn)鏈接、相關(guān)圖書鏈接和相關(guān)分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)鏈接功能，而MEDLINE聯(lián)機(jī)數(shù)據(jù)庫(kù)則沒有這些鏈接功能。