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外顯子、內(nèi)含子、mRNA、CDS關(guān)系

1.DNA復(fù)制:以DNA為模板,在DNA聚合酶的催化作用下,將四種游離的dNTP按照堿基互補(bǔ)配對(duì)原則合成新鏈DNA
轉(zhuǎn)錄:以DNA為模版,在DNA指導(dǎo)的RNA聚合酶的作用下,將四種游離的NTP按照堿基互補(bǔ)配對(duì)的原則合成RNA
翻譯:以mRNA為模板,在核糖體內(nèi)合成蛋白質(zhì)的過程
特點(diǎn):DNA復(fù)制   模板為雙鏈DNA,合成的新鏈與模板鏈一模一樣,原料為四種dNTP,為半保留復(fù)制    需要引物
             轉(zhuǎn)錄       模板為雙鏈DNA, 為半不連續(xù)轉(zhuǎn)錄            不需要引物                 原料為四種NTP
                              合成的新鏈除了把DNA上的T改為U外,其他一樣
             翻譯       模板為mRNA   原料為20中游離的氨基酸       3個(gè)堿基決定一個(gè)氨基酸


2.mRNA

mRNA (messenger RNA, 信使RNA)

信使RNA是由DNA經(jīng)hnRNA剪接而成,攜帶遺傳信息的能指導(dǎo)蛋白合成的一類單鏈核糖核酸。

 

3. 基因DNA分為編碼區(qū)和非編碼區(qū),編碼區(qū)包含外顯子和內(nèi)含子,一般非編碼區(qū)具有基因表達(dá)的調(diào)控功能,如啟動(dòng)子在非編碼區(qū)。編碼區(qū)則轉(zhuǎn)錄為mRNA并最終翻譯成蛋白質(zhì)。
外顯子和內(nèi)含子都被轉(zhuǎn)錄到mRNA前體hnRNA中,當(dāng)hnRNA進(jìn)行剪接變?yōu)槌墒斓膍RNA時(shí),內(nèi)含子被切除,而外顯子保留。實(shí)際上真正編碼蛋白質(zhì)的是外顯子,而內(nèi)含子則無編碼功能,

內(nèi)含子存在于DNA中,在轉(zhuǎn)錄的過程中,DNA上的內(nèi)含子也會(huì)被轉(zhuǎn)錄到前體RNA中,但前體RNA上的內(nèi)含子會(huì)在RNA離開細(xì)胞核進(jìn)行翻譯前被切除。

 

4.CDS  Sequence coding for amino acids in protein 蛋白質(zhì)編碼區(qū)  

  CDS是Coding sequence的縮寫,是編碼一段蛋白產(chǎn)物的序列,是結(jié)構(gòu)基因組學(xué)術(shù)語。

與開放讀碼框ORF的區(qū)別

 開放讀碼框是從一個(gè)起始密碼子開始到一個(gè)終止密碼子結(jié)束的一段序列;不是所有讀碼框都能被表達(dá)出蛋白產(chǎn)物,或者能表達(dá)出占有優(yōu)勢(shì)或者能產(chǎn)生生物學(xué)功能的蛋白。 CDS,是編碼一段蛋白產(chǎn)物的序列。 cds必定是一個(gè)orf。但也可能包括很多orf。 反之,每個(gè)orf不一定都是cds。 Open reading frame (ORF) - a reading frame that does not contain a nucleotide triplet which stops translation before formation of a complete polypeptide.  Coding sequence (CDS) - The portion of DNA that codes for transcription of messenger RNA  ORF-----translation, CDS----transcription  translation 是理論上的,而transcription則顯然是事實(shí)存在的。

 

5.外顯子拼接形成成熟的mRNA,多數(shù)基因都有UTR,它們也是外顯子拼接的產(chǎn)物,所以,你會(huì)發(fā)現(xiàn)mRNA的長度要大于CDS,只有CDS才編碼蛋白,AUG以前的mRNA編碼前導(dǎo)序列。

外顯子并不一定編碼蛋白質(zhì),成熟mRNA的UTR也可以是外顯子,外顯子就是RNA剪接后留下的部分
外顯子與CDS區(qū)不是完全一致的,cds區(qū)一定屬于外顯子,但是外顯子不一定是CDS區(qū),也就是說外顯子不一定都能翻譯成蛋白的。

mRNA包括UTR和CDS!

  

 

內(nèi)含子(intron)是斷裂基因中外顯子之間的間隔序列(intervening sequence,IVS),可參與前體RNA的轉(zhuǎn)錄,但其轉(zhuǎn)錄的RNA序列于轉(zhuǎn)錄后的加工中被切除,不包括于成熟的RNA分子中。外顯子(exon)在斷裂基因中,轉(zhuǎn)錄成熟RNA中相應(yīng)序列的DNA片段。

內(nèi)含子和外顯子的分界線在于:GU-AG法則。即每個(gè)內(nèi)含子的開始兩個(gè)堿基都是是GU(或GT),最后兩個(gè)是AG。


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