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在我們下載生信軟件的時(shí)候，經(jīng)常會(huì)看到三個(gè)平臺(tái)版本的下載鏈接，有windows、linux和mac三個(gè)版本。windows平臺(tái)版本是大家最常用的版本，另一部分小眾的mac用戶會(huì)下載軟件的mac版本，對于一般的用戶來說，最不可能下載的是linux版本，但是linux版本卻是最穩(wěn)定、性能最高的版本，為什么這么說？

首先，mac雖然系統(tǒng)穩(wěn)定，但其產(chǎn)業(yè)鏈封閉，價(jià)格高昂但是硬件相對低配，可擴(kuò)展性很低，如果處理較大的數(shù)據(jù)并不能通過提高硬件來縮減運(yùn)行時(shí)間。如果我們組建了一個(gè)雙路CPU共36核搭配128G內(nèi)存的服務(wù)器，我們有兩個(gè)平臺(tái)可以選擇，windows和linux。windows偏向圖形化操作，雖然卡頓的情況暫且可以用固態(tài)硬盤緩解，但是我們都遇到過在使用windows時(shí)軟件莫名的卡死、關(guān)閉的情況，如果一個(gè)跑了兩天的軟件就這么莫名其妙的卡死了，就問我們有沒有理由不生氣？反觀linux，系統(tǒng)穩(wěn)定，開源軟件眾多，部分版本也有圖形化界面（不建議使用圖形化界面），是對于中、大型測序數(shù)據(jù)處理的最好選擇。

之前筆者寫過一篇《Windows玩夠了？試試用VMware虛擬機(jī)安裝Linux》的文章，講述了如何在windows 上用VMware安裝ubuntu的方法，并在后面提及了一些linux發(fā)型版本。這里面有個(gè)最大的問題就是，虛擬機(jī)模擬安裝的linux執(zhí)行效率比較低，容易卡頓，即便是安裝在固態(tài)硬盤上也會(huì)有操作延遲感，并不適合處理稍大的程序。所以我們?nèi)绾卧谝慌_(tái)電腦上安裝linux單系統(tǒng)以及安裝后如何簡單的配置是一個(gè)很實(shí)用的話題。

要安裝linux，首先得談?wù)動(dòng)布渲?。對于主機(jī)來說，最主要的三個(gè)硬件是CPU，內(nèi)存和硬盤。按重要性來說，內(nèi)存>CPU >硬盤，生信的很多程序都是單核運(yùn)行的，如果沒強(qiáng)求多程序運(yùn)行的話一般家用電腦的雙核四線程足以應(yīng)付。家用電腦的一般內(nèi)存配置約在4G或者8G左右，但是如果數(shù)據(jù)量稍大很多程序?qū)?nèi)存的要求要大于這個(gè)量級，所以內(nèi)存是必須要擴(kuò)充的，其重要性大于CPU。一般硬盤1T就可以滿足一個(gè)項(xiàng)目的要求，占滿了可以拷出來，所以硬盤在這三者里重要性最低。當(dāng)然，還有個(gè)硬件叫顯卡，但是對生信處理來說沒什么用，可以忽略。

上一段可以得出一個(gè)結(jié)論，那就是家用的普通主機(jī)也完全可以作為小型服務(wù)器使用，前提是要花點(diǎn)錢升級下內(nèi)存條。鑒于現(xiàn)在內(nèi)存條比年前價(jià)格翻了一倍，所以保守點(diǎn)內(nèi)存升到16G也是可以的。當(dāng)然，有錢的升級內(nèi)存條越大越好。除了普通的家用機(jī)外，就是比較貴的專業(yè)服務(wù)器了，這些服務(wù)器也是IT公司必備的服務(wù)器，最常用的牌子是dell。

感覺寫的有些啰嗦，可能年紀(jì)大了吧。

差錢的，去某寶和某東選個(gè)至強(qiáng)的主機(jī)，幾千塊錢很便宜，但是其硬件的質(zhì)量不一定可靠，很多是公司淘汰下來的硬件，如果不放心就買品牌機(jī)的主機(jī)，這里還有個(gè)坑就是不要買太新的CPU，不然有一定的幾率安裝的linux版本沒有相關(guān)的CPU驅(qū)動(dòng)導(dǎo)致系統(tǒng)不穩(wěn)定。如果課題組給報(bào)銷或者不差錢的，可以選擇專業(yè)的服務(wù)器，穩(wěn)定，而且支持多路CPU、大容量內(nèi)存和磁盤陣列，是處理中、大型數(shù)據(jù)的首選。手頭上已有臺(tái)式機(jī)或者筆記本而且不想花錢的，那就湊活著用吧。

linux系統(tǒng)安裝的方法有很多，有光盤、U盤以及部分linux版本支持windows下面安裝器直接安裝。這里我使用的是大家手頭都有的U盤進(jìn)行安裝。安裝的linux版本是centos，至于為什么選擇centos，這里我跟大家啰嗦下。

之前《Windows玩夠了？試試用VMware虛擬機(jī)安裝Linux》這篇文章的最后也提了下幾個(gè)流行的發(fā)型版本，Deepin國內(nèi)的操作系統(tǒng)，界面漂亮，但是不夠穩(wěn)定，偏娛樂。Red Hat Enterprise Linux（rhel）是IT企業(yè)最常用的系統(tǒng)，特點(diǎn)是穩(wěn)定，需要收費(fèi)，有官方技術(shù)支持，缺點(diǎn)就是要收費(fèi)，當(dāng)然免費(fèi)的也可以用，但是yum被限制使用，再當(dāng)然yum也可以破解限制，但是比較麻煩。ubuntu是比較流行的一個(gè)版本了，界面和穩(wěn)定性都可以，自帶的軟件管理工具是apt，優(yōu)于yum。筆者當(dāng)初初學(xué)的系統(tǒng)是rhel，后來安裝上unbuntu后總感覺操作起來有那么一丟丟不流暢， 再加上ubuntu自帶的桌面不是很喜歡，所以筆者干脆放棄了ubuntu。rhel還有個(gè)克隆版就是centos，centos相對于rhel的缺點(diǎn)就是官方補(bǔ)丁會(huì)比rhel晚一天，優(yōu)點(diǎn)是完全免費(fèi)。筆者選擇centos的原因就在這了，免費(fèi)，穩(wěn)定，流行（出了bug好google解決方案）。

總結(jié)一下本篇的內(nèi)容：我們需要一個(gè)linux系統(tǒng)，如何選擇硬件以及用U盤安裝哪個(gè)版本的linux。這就是本系列的上篇內(nèi)容，中篇會(huì)教大家如何刻錄U盤、家用機(jī)centos安裝以及dell服務(wù)器的centos安裝，下篇會(huì)講述安裝完成后的幾個(gè)重要的系統(tǒng)配置、yum的使用以及依賴庫的安裝。

為什么這個(gè)系列要分成上、中、下三部分？因?yàn)楣P者喜歡《指環(huán)王》。

為什么起了一個(gè)吸引眼球的標(biāo)題？因?yàn)橐c(diǎn)擊率指標(biāo)。

為什么寫的這么啰嗦？因?yàn)楣P者是92年手捧保溫杯的中年人。